Sejak berdirinya pada Tahun 2007, Yayasan Air Adhi Eka (YAAE) telah mengalami beberapa perubahan Kepengurusan, baik unsur Pembina, Pengawas, maupun Pengurus. Tercatat, setidaknya sudah 6 kali dilakukan pergantian personil dalam rangka penyegaran dan dikarenakan berbagai sebab, diantaranya yang bersangkutan berhalangan tetap.
Perubahan terakhir dilakukan pada tanggal 10 September 2024 dengan dilangsungkannya Rapat Pembina YAAE, yang menghasilkan Susunan Kepengurusan baru dengan Akta Notaris Agus Riyanto SH.M.Kn Nomor 02 tanggal 13 September 2024, dan pengesahan Kementerian Hukum dan HAM Nomor AHU-AH.01.06-0048615 tanggal 13 September 2024.
Pada tanggal 15 Januari 2025 bertempat di Istora Jatiluhur Valley Resort, komplek Bedungan Ir. H. Djuanda, Purwakarta, Jawa Barat, dilakukan Serah Terima Kepengurusan YAAE secara simbolis dari pengurus lama kepada pengurus baru, disaksikan Sekretaris Ditjen Sumber Daya Air Ir. Airlangga mardjono, MT., Ketua Dewan Kehormatan YAAE DR.Ir. Djoko Kirmanto, Dipl.HE.dan jajaran pengurus lainnya, yakni:
1. Ketua Pembina, dari DR.Ir. Mochammad Amron, M.Sc. kepada DR.Ir. Imam Santoso, M.Sc.

2. Ketua Pengawas, dari Tjindra parma, SH, MH. Kepada Putranta Setyanugraha, SH, M.Si.

3. Ketua Umum, dari Ir. Adi sarwoko, Dipl.HE. kepada Ir. Adang Saf Ahmad, CES.

Susunan Kepengurusan Yayasan Air Adhi Eka:
I. Pembina:
· Ketua : DR.Ir. Imam Santoso, M.Sc.
· Anggota : 1. DR.Ir. Mochammad Amron, M.Sc.
2. Ir. Mudjiadi, M.Sc.
3. Ir. Susmono.
4. Ir. Rina Agustin Indriani, MURP.
6. Dr.Ir. Fahmi Hidayat, ST, MT.
7. Ir. Sugeng Rochadi, MM.
8. Ir. Colbert Thomas Pangaribuan, MM.
II. Pengawas:
· Ketua : Putranta Setyanugraha, SH, M.Si.
· Anggota : 1. Tjindra Parma, SH, MH.
2. Leonarda B. Ibnusaid, M.Eng.
III. Pengurus:
1. Ketua Umum : Ir. Adang Saf Ahmad, CES.
2. Ketua I : Ir. Erwando Rachmadi, ST, M.Sc.
3. Ketua II : Ir. Udien Yulianto, M.Tech.
4. Ketua III : Didiek Isqak, ST.
5. Sekretaris Umum : Dra. Yuni Erni Aguslin, M.Si.
6. Sekretaris : Drs. Usman Gunadi, MA.
7. Bendahara Umum:
8. Bendahara : Sri Setyawati, S.Sos, M.Si.
